Sobre el evento
Descripción general:
Les damos la bienvenida a las II Jornadas Andaluzas de BioInformática (JABI 2024), un foro de interacción desde el que se fomenta la sinergia dentro de la creciente comunidad de bioinformática en Andalucía.
Las JABI entienden la bioinformática en su sentido más amplio, como una disciplina que aglutina grupos que trabajan en ciencia de datos, biología computacional, genómica, biología de sistemas, evolución, estructura de biomoléculas, agricultura, informática médica, inteligencia artificial, etc., y desde un abanico de aproximaciones que va desde la investigación básica basada en datos a la orientación técnica del desarrollo de aplicaciones y software bioinformático.
Es un hecho que el abaratamiento de las tecnologías de producción de datos, como las distintas ómicas, imagen, datos clínicos, etc., está provocando un crecimiento en la comunidad bioinformática. En Andalucía existe un importante número de grupos con amplia experiencia en el manejo de datos ómicos y una clara orientación traslacional que conviven con otros grupos que provienen de la Ingeniería Informática con sólidos conocimiento en modernas técnicas de estadística e inteligencia artificial (IA) y vocación de aplicar estos conocimientos a problemas de biomedicina. También, numerosos grupos de investigación en biología molecular, clínicos, agricultura, etc. están dando el salto al análisis de datos incluyendo profesionales con perfil bioinformático en equipos teórico-experimentales.
Las JABI pretenden ser un foro de referencia en Andalucía para promover el intercambio de experiencias y conocimiento en la comunidad bioinformática de Andalucía y el establecimiento de relaciones entre grupos con intereses comunes o complementarios.
Comité de organización
Comité organizador:
- Pedro Carmona, Universidad de Granada / GENyO
- Ignacio Rojas, Universidad de Granada
- Francisco M. Ortuño, Universidad de Granada
- Coral del Val, Universidad de Granada
- Joaquin Dopazo, Plataforma de Medicina Computacional, FPS
- Javier Pérez Florido, Plataforma de Medicina Computacional, FPS
- Antonio J. Pérez , Universidad Pablo de Olavide
- Manuel G. Claros, Universidad de Málaga
- Isabel Nepomuceno, Universidad de Sevilla
Comité local:
- Adrián García Moreno, GENyO / Universidad de Granada
- Jordi Martorell Marugán, GENyO / Universidad de Granada
- Luis Javier Herrera, Universidad de Granada
Comité de estudiantes:
- Marina Vargas-Fernández, GENyO / Universidad de Granada
- Samuel Fernández Perez, GENyO / FIBAO
- Ivan Ellson Lancho, GENyO / FPS
Dónde
Facultad de Medicina:
Universidad de Granada, Facultad de Medicina, Salón de Actos
Av. Investigación 11, 18071 Granada
Fechas
- Fecha del evento: del 24 al 26 de Junio de 2024
- Apertura de registro y envio de comunicaciones: 10 de Marzo de 2024
- Fecha límite de envio de comunicaciones:
20 de Mayo27 de Mayo de 2024 - Notificaciones de comunicaciones: 3 de Junio de 2024
- Fecha límite de registro: 10 de Junio de 2024
Contribuciones
Instrucciones para la subida de trabajos
Las contribuciones para estas jornadas se enviarán en forma de resumen o abstract corto. Las contribuciones serán selecionadas posteriormente para su presentación en sesiones orales o sesión de póster..
Las temáticas de las contribuciones incluirán algunos de los siguientes topics (pero no limitado a ellos) muy demandados en Bioinformática:
- Metodologías: ómicas, single-cell, inteligencia artificial, aplicaciones y software, etc
- Ámbitos: salud, clínica, microbiología, microbioma, enfermedades raras, ecología, plantas, etc
No obstante, el comité de programa establecerá las sesiones que considere agrupando las temáticas de la forma más homogénea posible.
Todas las contribuciones están disponibles en nuestro Libro de Actas. La indexación de dichas contribuciones con un ISBN estará disponible en breve.
Programa
Inicio del evento
Registro
Confirmación de los datos de inscripción.
Inauguración de las JABI
D. José Juán Jiménez Moleón
Delegado del Rector Para la Salud y las Relaciones con el Sistema Sanitario Universidad de GranadaDña. Aurora Valenzuela Garach
Decana de la Facultad de Medicina Universidad de GranadaD. Luis González
Director Gerente de la Fundación del Parque Tecnológico de la Salud (PTS) GranadaD. Pedro Carmona
Profesor Titular Departamento de Estadística (Universidad de Granada) / Centro de Genómica e Investigación Oncológica (GENyO)Sesión 1 - Bioinformática Clínica
Chairman: Coral del Val, Universidad de GranadaCod: s1_1
Hallazgos Secundarios en CSVS, la Base de Datos de Variabilidad Genética Española Rosario Carmona
Plataforma de Medicina Computacional, Fundación Progreso y Salud, Sevilla
Cod: s1_2
Los efectos de la divergencia evolutiva en el gen HLA-DQB1 en Lupus Sistémico Eritematoso Ruth Domínguez Rodríguez
Centro de Genómica e Investigación Oncológica (GENyO), Granada
Cod: s1_3
Integración a distintos niveles transcriptómicos para descifrar los mecanismos de resistencia primaria a inhibidores de puntos de control en pacientes con melanoma Juan Luís Onieva Zafra
Instituto de Investigación Biomédica de Málaga (IBIMA), Universidad de Málaga, Málaga
Cod: s1_4
IRPVS: la base de datos de variabilidad genética de población romaní española Javier Pérez Florido
Plataforma de Medicina Computacional, Fundación Progreso y Salud, Sevilla
Cod: s1_5
Candidate genes for severe tinnitus based on the impact of rare variants in coding regions Alba Escalera Balsera
Instituto de Investigacion Biosanitaria (ibs.GRANADA), Granada
Descanso / Café
Charla plenaria: La importancia de la Bioinformática en la investigación translacional de los microRNAs. Michael Hackenberg
Profesor Catedrático del Departamento de Genética de la Universidad de Granada
Sesión 2 - Inteligencia Artificial y Ciencia de Datos en Bioinformática
Chairman: Isabel Nepomuceno, Universidad de SevillaCod: s2_1
Towards Digital Quantification of Ploidy from Pan-Cancer Digital Pathology Slides using Deep Learning Francisco Carrillo Perez
Stanford University (USA)
Cod: s2_2
Predicción de precisión en hepatitis C Alberto Esteban Medina
Plataforma de Medicina Computacional, Fundación Progreso y Salud, Sevilla
Cod: s2_3
Evaluation of an explainable AI algorithm for the classification of genetic variants in hereditary cancer Laura Martínez Gómez
Fujitsu Research of Europe (Sponsor)
Charla plenaria: Medicina de precisión en Enfermedades Autoinmunes Sistémicas. Marta Alarcón
Directora Científica del Centro de Genómica e Investigación Oncológica (GENYO) de Granada.
Café + Posters
Sesión 3 - Análisis e integración de datos -ómicos
Chairman: Javier Pérez Florido, Plataforma de Medicina Computacional, SevillaCod: s3_1
El primer análisis del metiloma de pacientes con la enfermedad de Erdheim-Chester revela nuevos genes involucrados en su patogénesis Miriam Cerván Martín
Instituto de Parasitología y Biomedicina López-Neyra (IPBLN-CSIC), Granada
Cod: s3_2
Expresión de miARN como predictor de supervivencia en leucemia mieloide aguda pediátrica: evaluación sistemática de un nuevo modelo Iván Ellson
Centro de Genómica e Investigación Oncológica (GENYO), Granada
Cod: s3_3
Asociación entre Complicaciones Cardiometabólicas y Mortalidad con una Firma Metabólica Derivada de un Patrón Dietético Poco Saludable: Análisis Prospectivo de la Cohorte del UK Biobank Álvaro Torres Martos
Departamento de Bioquímica y Biología Molecular II, Universidad de Granada, Granada
Cod: s3_4
La hipermutación somática aberrante causa mutaciones de splicing recurrentes en linfoma difuso de célula B María S. Benítez Cantos
Departamento de Bioquímica y Biología Molecular III e Inmunología, Universidad de Granada, Granada
Mesa redonda: Gestión y Análisis de Historiales Clínicos Electrónicos
Moderador: D. Pedro Carmona
Dña. María José Sánchez - Directora Científica del Instituto de Investigación Sanitaria (ibs.GRANADA)
Dña. Beatriz Martínez Sánchez - Jefa del Servicio de Tecnologías de la Información, Hospital Universitario Clínico San Cecilio
D. Joaquín Dopazo - Director de la Plataforma de Medicina Computacional, Fundación Progreso y Salud
D. Javier Lopez - Lead Bioinformatics Engineer, Genomics England (GEL)
Almuerzo
Sesión de Póster + Café
Sesión 4 - Herramientas y Software en Bioinformática
Chairman: Adrián García Moreno, Regional Student Group (RSG-Spain, ISCB)Cod: s4_1
GSEMA: Gene Set Enrichment Meta-Analysis para integración de estudios con genes faltantes Juan Antonio Villatoro García
Centro de Genómica e Investigación Oncológica (GENYO), Granada
Cod: s4_2
drexml: Software libre para el descubrimiento de dianas terapéuticas Carlos Loucera
Plataforma de Medicina Computacional, Fundación Progreso y Salud, Sevilla
Cod: s4_3
Making the most of your transcriptomic landscapes: A computational workflow to quantify activity of context-specific biological functions at the single-cell level José Luis Ruiz
Instituto de Parasitología y Biomedicina López-Neyra (IPBLN-CSIC), Granada
Charla plenaria: Medicina de Sistemas aplicada al estudio de enfermedades genéticas raras. Juan A. García Ranea
Director del Departamento de Biología Molecular y Bioquímica de la Universidad de Málaga.
Sesión 5 - Plataformas para la investigación en Bioinformática
Chairman: Francisco Manuel Ortuño, Universidad de GranadaCod: s5_1
La importancia de divulgar la investigación en Bioinformática Charo Cobano Lora
Fundación Progreso y Salud, Sevilla
Cod: s5_2
Andalucía-Biotec: Desarrollo de tecnologías biomédicas y bioinformáticas en plataformas de transcriptómica espacial, para la implantación efectiva de la Medicina de Precisión en Andalucía. Eduardo Andrés León
Instituto de Parasitología y Biomedicina López-Neyra (IPBLN-CSIC), Granada
Cod: s5_3
Transformando la Bioinformática: Agilidad y Optimización en la Nube Natalia Jiménez Lozano
Life Sciences Business Developer Manager, Viridien
Charla plenaria: Retos para las/los bioinformáticas/os en el presente y en el futuro Alfonso Valencia
Director del Departamento de Ciencias de la Vida en el Centro Nacional de Supercomputación de Barcelona (BSC)
Descanso / Café
Sesión 6 - Bioinformática aplicada a Plantas
Chairman: M. Gonzalo Claros, Universidad de MálagaCod: s6_1
Estudio de la biodiversidad funcional bacteriana en compost de alpeorujo de origen industrial María José Estrella González
Universidad de Almería, Almería
Cod: s6_2
Análisis bioinformático de los alérgenos del polen de olivo Amanda Bullones
Instituto de Hortofruticultura Subtropical y Mediterránea (IHSM-CISC), Málaga
Cod: s6_3
Caracterización del Transcriptoma y Análisis de S-Acilación en el Polen de Lilium longiflorum como Especie Modelo en Palinología Andrea Román Mateo
Estación Experimental del Zaidín (EEZ-CSIC), Granada
Charla plenaria: Pangenomes reveal the genetic diversity of plants. Bruno Contreras
Científico Titular, Consejo Superior de Investigaciones Científicas Estación Experimental de Aula Dei, Zaragoza.
Sesión 7 - Microbiología y Metagenómica
Chairman: Luis Javier Herrera, Universidad de GranadaCod: s7_1
Unlocking the Potential of PacBio HiFi to obtain complete and high-quality genomes of the malaria parasite Plasmodium falciparum Bárbara Díaz Terenti
Instituto de Parasitología y Biomedicina López-Neyra (IPBLN-CSIC), Granada
Cod: s7_2
Fecal Microbiota Transplantation Alters the Proteomic Landscape of Inflammation in HIV: Identifying Bacterial Drivers Claudio Díaz García
Hospital Universitario Ramón y Cajal, Universidad de Alcalá, Madrid
Cod: s7_3
Small RNA Landscape in Ixodes ricinus Saliva: Unveiling the Cooperative Effect of miRNAs at the Tick-Host Interface José María Medina Muñoz
Departamento de Genética, Universidad de Granada, Granada
Clausura
Ponentes invitados
Ponentes confirmados
Alfonso Valencia
Director del Departamento de Ciencias de la Vida en el Centro Nacional de Supercomputación de Barcelona (BSC).
Marta Alarcón
Directora Científica del Centro de Genómica e Investigación Oncológica (GENYO) de Granada.
Michael Hackenberg
Profesor Catedrático del Departamento de Genética de la Universidad de Granada
Juan Antonio García Ranea
Director del Departamento de Biología Molecular y Bioquímica de la Universidad de Málaga
Bruno Contreras Moreira
Científico Titular, Consejo Superior de Investigaciones Científicas Estación Experimental de Aula Dei, Zaragoza
Maria José Sánchez Pérez
Directora Científica del Instituto de Investigación Sanitaria (ibs.GRANADA)
Sebastián Ventura
Catedrático de Universidad, Departamento de Ciencias de la Computación y Análisis Numérico, Universidad de Córdoba
Beatriz Martínez Sánchez
Jefa del Servicio de Tecnologías de la Información, Hospital Universitario Clínico San Cecilio
Javier López
Lead Bioinformatics Engineer, Genomics England (GEL)
Localización Del Evento
Galería e información sobre la ubicación del evento
Facultad de Medicina:
Universidad de Granada, Facultad de Medicina
Salón de Actos
Av. Investigación 11, 18071 Granada
Recomendación de alojamiento
Algunos alojamientos cercanos al evento
F.A.Q
Preguntas frecuentes
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¿Cuándo y dónde se realizará el evento de bioinformática?
El evento de Bioinformática tendrá lugar del 24 al 26 de Junio en la Facultad de Medicina, Universidad de Granada, Salón de Actos - Avd. de la Investigación, 18071 Granada.
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¿Cómo participo en el evento?
El envío de contribuciones ha finalizado.
-
¿Cómo se realiza el pago?
Una vez inscrito/a al evento, se le enviarán instrucciones para realizar el pago de la inscripción.
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¿Qué temas se cubrirán en el evento?
Las jornadas están enfocadas a la bioinformática en su sentido más amplio, como una disciplina que aglutina grupos que trabajan en ciencia de datos, biología computacional, genómica, biología de sistemas, evolución, estructura de biomoléculas, informática médica, inteligencia artificial, etc., y desde un abanico de aproximaciones que va desde la investigación básica basada en datos a la orientación técnica del desarrollo de aplicaciones y software bioinformático.
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Facultad de MedicinaUniversidad de Granada
Avenida de la Investigación 11, 18071 Granada, Spain